利用元基因组学、元转录组学、元蛋白组学、元代谢组学与高通量深度测序等技术研究海绵、珊瑚共生微生物群落的代谢潜力；揭示原位的海绵、珊瑚共生微生物（细菌、放线菌、古菌、真菌、藻类）多样性及其空间分布特点；通过功能基因检测、功能微生物种群分析、代谢潜力预测，了解海绵、珊瑚共生微生物在宿主的营养与能量转换、C/N/P循环、化学防御中的作用。