（1）探索建立高效的海洋共生微生物分离技术，从海绵、珊瑚、海参等海洋生物中分离培养具有应用价值的海洋放线菌、真菌，建立海洋共生微生物菌种资源库。

（2）筛选具有生物活性（抗菌、抗肿瘤等）的海洋共生微生物，利用发酵工程、代谢工程、天然产物化学等技术分离制备、大量生产具有药用价值的海洋天然产物，建立海绵、珊瑚等来源的共生微生物药源物质大规模发酵制备技术，探索解决药源限制的新途径。

 （4）从分离的海洋共生微生物制备具有重要利用价值的海洋共生微生物来源的新型海洋生物酶；利用元基因组技术，从未培养的海洋共生微生物中克隆生物酶功能基因，利用基因工程技术制备相关生物酶。